Alors qu'il rentre à sa base, l'équipage de l'Enterprise doit faire face à des forces terroristes implacables au sein même de son organisation. L'ennemi a fait exploser la flotte et tout ce qu'elle représentait, plongeant notre monde dans le chaos.
Le ministère de l'Intérieur engage un génie et son équipe hétéroclite de prodiges pour protéger la nation d'une nouvelle génération sophistiquée de terroristes.